郑州商都遗址博物院是一座专题遗址博物馆，展览内容以商都历史文明为核心，向世人徐徐揭开这座沉寂3600余年都城的神秘面纱，解码中国早期文明的千年根脉。序厅镂空的洛阳铲造型，寓意郑州商代都城是一座由考古发现的千年王都。
第一展厅为复原展厅，步道走廊展板介绍了郑州商代都城在世界文明史与中国文明史中的重要地位。第二展厅包括三个单元：文明摇篮、玄鸟生商、巍巍商都。第三展厅包括两个单元：大邑商都、四方之极。大邑商都单元介绍郑州商代都城作为当时最大、最繁荣的经济文化中心。四方之极取自《诗经·商颂·殷武》中“商邑翼翼，四方之极”，展示商王朝的地域控制，商文化的辐射影响以及郑州地区商代的历史文化延续。第四展厅包括两个单元：生生不息、守望保护。
